В Таврической духовной семинарии активно ведется научная работа, сопровождаемая апробациями в виде ежегодно проводимых научных конференций.
Так, в марте 2025 года состоится ежегодная Всероссийская научно-богословская конференция с международным участием «Пятые Таврические Гурьевские чтения», направления работы которой будут посвящены жизни и служению святителя Гурия (Карпова), духовному наследию святителя Луки, архиепископа Симферопольского и Крымского, а также подвигам святых новомучеников и исповедников Русской Церкви, вопросам православной психологии и актуальным проблемам современной православной теологии.
Святитель Гурий Архиепископ Таврический (Григорий Платонович Карпов в миру), был выдающимся ученым, этнографом, синологом и знатоком культуры, философии, языка и обычаев Китая, автором классического перевода Евангелия на китайский язык. После завершения дипломатической работы и миссионерского служения на Дальнем Востоке, святитель Гурий был назначен на Таврическую епископскую кафедру, которую возглавлял в течение 15 лет, вплоть до своей смерти в 1882 году. Именно благодаря его усилиям в этот период в Крыму были открыты первые учебные заведения: в 1873 году духовная семинария и два духовных училища – мужское и женское. С 1876 года являлся почетным членом Церковно-Археологического общества и Киевской духовной академии.
В апреле 2025 года на базе Культурного центра «Музейно-храмовый комплекс Новый Херсонес» состоится научно-образовательная конференция «Таврическая епархия на рубеже двух эпох», приуроченная к 100-летию блаженной кончины свт. Тихона, Патриарха Московского и всея России.
В мае 2025 года традиционно стартует Международная междисциплинарная научная конференция «Проблемы души нашего времени», в которой примут участие богословы, представители гуманитарных и естественных наук. Будут затронуты вопросы стыковых пограничных направлений научных знаний.
Продолжая опыт I Всероссийской научно-практической конференции «Жизнь, деятельность и духовное наследие новомучеников и исповедников Крыма в XX веке», администрацией Семинарии было решено в июне 2025 года провести конференцию, посвященную Архиерейскому Собору 2000 года, делая акцент на биографистику, эгоисторию и житийное описание новомучеников XX века, пострадавших за Христа в годы лихолетья и безбожной пятилетки.